Ен-Яхинское НГК месторождение находится в северной части Западно-Cибирской низменности в верхнем течении несудоходных рек Хадуттэ и Таб-Яха — левых притоков реки Пур. В административном отношении территория Ен-Яхинского НГК месторождения входит в состав Пуровского района (районный центр пос.Тарко-Сале) Ямало-Ненецкого автономного округа Тюменской области.